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Chem Eng J | IF=13.3,纳米蛋白冠血浆蛋白质组学破解心血管-癌症共病的"分子密码"

心血管疾病(CVD)和癌症之间存在复杂的相互作用,其中动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)与前列腺癌(PC)的发生发展密切相关,这两种疾病的共存会加速PC的转移进程,显著恶化患者的预后。尽管目前有针对前列腺特异性抗原筛查等诊断手段,但其特异性不足,难以精准识别高风险患者。

 

2025年3月1日,美国奥古斯塔大学乔治亚医学院心血管科Avirup Guha团队在Chemical Engineering Journal (IF 13.3) 发表文章“AI-driven prediction of cardio-oncology biomarkers through protein corona analysis”。利用基于纳米颗粒的蛋白质冠分析结合质谱分析、AI机器学习和因果关系分析,识别出与血浆中ASCVD和转移性前列腺癌(mPC)相关的关键蛋白质和通路,为心血管肿瘤学领域提供新的诊断思路和治疗靶点。

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研究思路

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  • 样本分组:nmPC 无 ASCVD(n=5);

  • mPC 无 ASCVD(n=10);

  • nmPC + ASCVD(n=10);

  • mPC + ASCVD(n=10)共35例血浆样本

注:转移性前列腺癌(mPC);非转移性前列腺癌(nmPC)


研究亮点

创新性蛋白标志物筛选:通过开发血浆蛋白冠富集技术结合质谱分析,并整合AI机器学习与因果分析,鉴定出22种与ASCVD和mPC强相关的潜在生物标志物,如CCT7和TBXAS1。

关键致病因子解析:基于因果分析,首次明确TBXAS1是促进ASCVD和mPC进展的关键致病因子,揭示其在血管重塑和肿瘤进展中的作用。

技术方法学突破:研究证实,蛋白冠富集技术可显著提升血浆低丰度蛋白的检出,可以显著提高生物标志物检测的灵敏度和特异性。

 

主要结论

一、血浆蛋白组学分析揭示了与ASCVD和mPC相关的关键蛋白

研究团队采用创新的纳米颗粒蛋白冠富集技术,在35例血浆样本中共鉴定了887种蛋白质,其中260种蛋白质在所有样本中均有检测到,并分析了共有蛋白的在不同组中的表达差异(图2A-C)。GO富集分析显示,与仅有mPC的患者相比,mPC合并ASCVD患者中,与补体激活、纤溶、凝血、先天免疫反应以及Arp2/3复合体介导的肌动蛋白成核相关的通路显著富集(图2D)。此外,这些患者组还表现出独特的通路激活模式。

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图2:基于蛋白质冠富集技术的血浆蛋白质组学分析

二、CCT7作为ASCVD和mPC的双重生物标志物具有潜力

研究团队采用LASSO逻辑回归模型,对血浆蛋白质数据进行特征选择(图3A),并确定了一组与转移显著相关的蛋白,分别识别出12种与ASCVD密切相关以及11种与转移密切相关的蛋白质(图3B-C)。其中TCP1亚基7的分子伴侣蛋白(CCT7)是唯一与两种疾病都相关的蛋白质,在mPC和ASCVD患者中均显著上调,表明其作为双重生物标志物用于同时监测两种疾病的潜力。

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图3:机器学习筛选血浆蛋白标志物

三、TBXAS1被鉴定为ASCVD与mPC的共同致病因素

因果分析中,研究团队最初分析了887种蛋白质,但由于样本量有限(仅35个),算法识别出400种潜在因果蛋白,难以有效区分真实因果关系。最终,团队聚焦于与ASCVD或mPC强相关的22种蛋白质,确定血栓素A合成酶1(TBXAS1)、肌动蛋白β和真核翻译起始因子5A-1是ASCVD的致病因子,TBXAS1也是mPC的致病因子。将TBXAS1确定为ASCVD和mPC的共同致病因素,表明其在两种疾病的发病机制中发挥关键作用。

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图4:因果分析确定致病因子


研究总结

这项研究通过整合基于纳米颗粒的蛋白质冠富集技术、质谱分析、机器学习和因果分析,揭示了与ASCVD和mPC相关的关键蛋白质和通路,其中CCT7和TBXAS1作为ASCVD和mPC的潜在生物标志物脱颖而出,值得一提,TBXAS1在传统血浆蛋白质组学分析中未被检测到,但在蛋白质冠富集分析中可检测到,也凸显了蛋白质冠富集分析在血浆生物标志物发现中的优势。

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